MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanococcus maripaludis C5 chromosome

Total Repeats: 41761

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009135	A	7	7	3	9	100 %	0 %	0 %	0 %	134045047
2	NC_009135	GTTTA	2	10	11	20	20 %	60 %	20 %	0 %	134045047
3	NC_009135	GTTA	2	8	68	75	25 %	50 %	25 %	0 %	134045047
4	NC_009135	GAA	2	6	78	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045047
5	NC_009135	A	6	6	82	87	100 %	0 %	0 %	0 %	134045047
6	NC_009135	A	6	6	91	96	100 %	0 %	0 %	0 %	134045047
7	NC_009135	TTC	2	6	98	103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045047
8	NC_009135	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	134045047
9	NC_009135	TTCA	2	8	220	227	25 %	50 %	0 %	25 %	134045047
10	NC_009135	ATT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045047
11	NC_009135	A	6	6	316	321	100 %	0 %	0 %	0 %	134045047
12	NC_009135	ATTG	2	8	329	336	25 %	50 %	25 %	0 %	134045047
13	NC_009135	AAT	2	6	350	355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045047
14	NC_009135	TGGA	2	8	394	401	25 %	25 %	50 %	0 %	134045047
15	NC_009135	A	6	6	440	445	100 %	0 %	0 %	0 %	134045047
16	NC_009135	ACA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045047
17	NC_009135	GAA	2	6	459	464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045047
18	NC_009135	A	6	6	472	477	100 %	0 %	0 %	0 %	134045047
19	NC_009135	GCAATC	2	12	516	527	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	134045047
20	NC_009135	CAA	2	6	529	534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	134045047
21	NC_009135	GGTG	2	8	656	663	0 %	25 %	75 %	0 %	134045047
22	NC_009135	T	6	6	672	677	0 %	100 %	0 %	0 %	134045047
23	NC_009135	A	6	6	769	774	100 %	0 %	0 %	0 %	134045048
24	NC_009135	GATT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	134045048
25	NC_009135	A	6	6	790	795	100 %	0 %	0 %	0 %	134045048
26	NC_009135	ATT	2	6	858	863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045048
27	NC_009135	AAT	2	6	878	883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045048
28	NC_009135	GAA	2	6	977	982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
29	NC_009135	TTC	2	6	1024	1029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045048
30	NC_009135	A	6	6	1070	1075	100 %	0 %	0 %	0 %	134045048
31	NC_009135	A	7	7	1148	1154	100 %	0 %	0 %	0 %	134045048
32	NC_009135	AAT	2	6	1166	1171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045048
33	NC_009135	GAA	2	6	1196	1201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
34	NC_009135	A	8	8	1282	1289	100 %	0 %	0 %	0 %	134045048
35	NC_009135	GAT	2	6	1322	1327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045048
36	NC_009135	TAAAA	2	10	1378	1387	80 %	20 %	0 %	0 %	134045048
37	NC_009135	ATT	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045048
38	NC_009135	GAA	2	6	1463	1468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
39	NC_009135	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045048
40	NC_009135	TAA	2	6	1482	1487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045048
41	NC_009135	AAG	2	6	1495	1500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
42	NC_009135	TATT	2	8	1504	1511	25 %	75 %	0 %	0 %	134045048
43	NC_009135	TCC	2	6	1522	1527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134045048
44	NC_009135	ATATTG	2	12	1602	1613	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	134045048
45	NC_009135	CAAA	2	8	1614	1621	75 %	0 %	0 %	25 %	134045048
46	NC_009135	CAG	2	6	1632	1637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045048
47	NC_009135	GAA	2	6	1649	1654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
48	NC_009135	AT	3	6	1667	1672	50 %	50 %	0 %	0 %	134045048
49	NC_009135	AGA	2	6	1708	1713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045048
50	NC_009135	A	6	6	1763	1768	100 %	0 %	0 %	0 %	134045048
51	NC_009135	GAAA	2	8	1941	1948	75 %	0 %	25 %	0 %	134045049
52	NC_009135	AT	3	6	1965	1970	50 %	50 %	0 %	0 %	134045049
53	NC_009135	G	7	7	1987	1993	0 %	0 %	100 %	0 %	134045049
54	NC_009135	A	6	6	2014	2019	100 %	0 %	0 %	0 %	134045049
55	NC_009135	GCA	2	6	2092	2097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045049
56	NC_009135	ATT	2	6	2168	2173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045049
57	NC_009135	TTG	2	6	2177	2182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	134045049
58	NC_009135	ATT	2	6	2219	2224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045049
59	NC_009135	A	7	7	2328	2334	100 %	0 %	0 %	0 %	134045049
60	NC_009135	AGA	2	6	2379	2384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045049
61	NC_009135	TAC	2	6	2392	2397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045049
62	NC_009135	A	6	6	2399	2404	100 %	0 %	0 %	0 %	134045049
63	NC_009135	AAT	2	6	2439	2444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045049
64	NC_009135	A	6	6	2454	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	134045049
65	NC_009135	GAT	2	6	2464	2469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045049
66	NC_009135	TAT	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009135	ATT	2	6	2513	2518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045050
68	NC_009135	T	7	7	2517	2523	0 %	100 %	0 %	0 %	134045050
69	NC_009135	CTTTT	2	10	2619	2628	0 %	80 %	0 %	20 %	134045050
70	NC_009135	TTC	2	6	2679	2684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045050
71	NC_009135	T	7	7	2690	2696	0 %	100 %	0 %	0 %	134045050
72	NC_009135	T	6	6	2701	2706	0 %	100 %	0 %	0 %	134045050
73	NC_009135	GATTC	2	10	2725	2734	20 %	40 %	20 %	20 %	134045050
74	NC_009135	TA	3	6	2831	2836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009135	ATT	2	6	2843	2848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045051
76	NC_009135	TATT	2	8	2872	2879	25 %	75 %	0 %	0 %	134045051
77	NC_009135	T	8	8	2935	2942	0 %	100 %	0 %	0 %	134045051
78	NC_009135	AGT	2	6	2962	2967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045051
79	NC_009135	ATT	2	6	2991	2996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045051
80	NC_009135	AAT	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
81	NC_009135	A	6	6	3018	3023	100 %	0 %	0 %	0 %	134045051
82	NC_009135	T	6	6	3070	3075	0 %	100 %	0 %	0 %	134045051
83	NC_009135	TTC	2	6	3079	3084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045051
84	NC_009135	AAT	2	6	3268	3273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
85	NC_009135	TGA	2	6	3336	3341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045051
86	NC_009135	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	134045051
87	NC_009135	TAA	3	9	3379	3387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
88	NC_009135	ATA	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
89	NC_009135	A	6	6	3411	3416	100 %	0 %	0 %	0 %	134045051
90	NC_009135	AAG	2	6	3430	3435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045051
91	NC_009135	TGTT	2	8	3450	3457	0 %	75 %	25 %	0 %	134045051
92	NC_009135	T	6	6	3494	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	134045051
93	NC_009135	AT	3	6	3501	3506	50 %	50 %	0 %	0 %	134045051
94	NC_009135	TTTAA	2	10	3539	3548	40 %	60 %	0 %	0 %	134045051
95	NC_009135	ATA	2	6	3581	3586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
96	NC_009135	ATA	2	6	3761	3766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
97	NC_009135	AAT	2	6	3787	3792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045051
98	NC_009135	GAT	2	6	3850	3855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045052
99	NC_009135	AGA	2	6	3985	3990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045052
100	NC_009135	TCAA	2	8	4095	4102	50 %	25 %	0 %	25 %	134045052
101	NC_009135	AGA	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045052
102	NC_009135	TAAA	2	8	4211	4218	75 %	25 %	0 %	0 %	134045052
103	NC_009135	GTA	2	6	4222	4227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045052
104	NC_009135	ATC	2	6	4382	4387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045052
105	NC_009135	TGG	2	6	4427	4432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134045052
106	NC_009135	A	7	7	4469	4475	100 %	0 %	0 %	0 %	134045052
107	NC_009135	TAA	2	6	4490	4495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045052
108	NC_009135	A	6	6	4521	4526	100 %	0 %	0 %	0 %	134045052
109	NC_009135	TA	3	6	4560	4565	50 %	50 %	0 %	0 %	134045052
110	NC_009135	GAA	2	6	4649	4654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045053
111	NC_009135	ATA	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045053
112	NC_009135	A	6	6	4803	4808	100 %	0 %	0 %	0 %	134045053
113	NC_009135	AGA	2	6	4855	4860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	134045053
114	NC_009135	AAT	2	6	4861	4866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045053
115	NC_009135	A	6	6	4868	4873	100 %	0 %	0 %	0 %	134045053
116	NC_009135	ATGA	2	8	4886	4893	50 %	25 %	25 %	0 %	134045053
117	NC_009135	ATA	2	6	5008	5013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045054
118	NC_009135	TTAC	2	8	5017	5024	25 %	50 %	0 %	25 %	134045054
119	NC_009135	AGAA	2	8	5223	5230	75 %	0 %	25 %	0 %	134045054
120	NC_009135	AATA	2	8	5249	5256	75 %	25 %	0 %	0 %	134045054
121	NC_009135	A	6	6	5340	5345	100 %	0 %	0 %	0 %	134045054
122	NC_009135	A	6	6	5368	5373	100 %	0 %	0 %	0 %	134045054
123	NC_009135	ACT	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045054
124	NC_009135	T	6	6	5428	5433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009135	T	7	7	5435	5441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009135	TAAATT	2	12	5457	5468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009135	ATT	2	6	5476	5481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009135	ATTA	2	8	5505	5512	50 %	50 %	0 %	0 %	134045055
129	NC_009135	AATT	2	8	5513	5520	50 %	50 %	0 %	0 %	134045055
130	NC_009135	GAT	2	6	5576	5581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045055
131	NC_009135	TTGT	2	8	5662	5669	0 %	75 %	25 %	0 %	134045055
132	NC_009135	GTG	2	6	5696	5701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	134045055
133	NC_009135	GATCT	2	10	5714	5723	20 %	40 %	20 %	20 %	134045055
134	NC_009135	CTT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045055
135	NC_009135	ATG	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045055
136	NC_009135	ACC	2	6	5951	5956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045055
137	NC_009135	GGAT	2	8	5987	5994	25 %	25 %	50 %	0 %	134045055
138	NC_009135	TGTT	2	8	6037	6044	0 %	75 %	25 %	0 %	134045055
139	NC_009135	TCT	2	6	6063	6068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045055
140	NC_009135	GCA	2	6	6069	6074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	134045055
141	NC_009135	AC	3	6	6093	6098	50 %	0 %	0 %	50 %	134045055
142	NC_009135	CTT	2	6	6223	6228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045055
143	NC_009135	CCG	2	6	6234	6239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	134045055
144	NC_009135	TTGT	2	8	6287	6294	0 %	75 %	25 %	0 %	134045055
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147	NC_009135	T	6	6	6332	6337	0 %	100 %	0 %	0 %	134045055
148	NC_009135	TCT	2	6	6342	6347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045055
149	NC_009135	ATT	2	6	6468	6473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045055
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179	NC_009135	TG	3	6	8059	8064	0 %	50 %	50 %	0 %	134045058
180	NC_009135	CTG	3	9	8193	8201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	134045058
181	NC_009135	T	6	6	8206	8211	0 %	100 %	0 %	0 %	134045058
182	NC_009135	CCT	2	6	8229	8234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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238	NC_009135	TTA	2	6	11129	11134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_009135	AT	4	8	11147	11154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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242	NC_009135	AT	3	6	11254	11259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
243	NC_009135	A	7	7	11269	11275	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
244	NC_009135	ATT	2	6	11308	11313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	134045063
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255	NC_009135	T	6	6	11891	11896	0 %	100 %	0 %	0 %	134045063
256	NC_009135	TAATC	2	10	11904	11913	40 %	40 %	0 %	20 %	134045063
257	NC_009135	GTA	2	6	11915	11920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	134045063
258	NC_009135	ATC	2	6	11939	11944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	134045063
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260	NC_009135	ACC	2	6	11981	11986	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045063
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265	NC_009135	GA	3	6	12099	12104	50 %	0 %	50 %	0 %	134045063
266	NC_009135	TCC	2	6	12119	12124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	134045063
267	NC_009135	CTT	2	6	12147	12152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	134045063
268	NC_009135	AATG	2	8	12251	12258	50 %	25 %	25 %	0 %	134045063
269	NC_009135	ACC	2	6	12296	12301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	134045063
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271	NC_009135	T	7	7	12349	12355	0 %	100 %	0 %	0 %	134045063
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402	NC_009135	T	6	6	18757	18762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
403	NC_009135	T	6	6	18785	18790	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_009135	ATATT	2	10	18804	18813	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_009135	TA	4	8	18843	18850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_009135	GAA	2	6	18859	18864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
407	NC_009135	TAT	2	6	18872	18877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_009135	ATC	2	6	18879	18884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
409	NC_009135	ATA	2	6	18905	18910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045070
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412	NC_009135	A	6	6	19058	19063	100 %	0 %	0 %	0 %	134045070
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424	NC_009135	AAT	2	6	19449	19454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	134045070
425	NC_009135	TAA	2	6	19462	19467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_009135	A	6	6	19855	19860	100 %	0 %	0 %	0 %	134045071
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466	NC_009135	A	6	6	21161	21166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_009135	TAATA	2	10	22709	22718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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